应急救援系统的组织机构包括以下五个运作核心：
1．紧急运转指挥核心：以组织协调应急救援中各个机构运作，统筹整个应急救援行动，现场应急的指挥工作、人员调度、资源的有效利用；
2．救援专家核心：参谋作用，对应急救援事故的现存和潜在的危险评估、预测事态及发展趋势、提出决策性的建议，包括应急力量的重新调整和布署、个人防护、公众疏散、抢险、监测、清消、现场恢复等方面。
3．支持保障核心：提供应急物质资源和人员支持的后方保障，包括提供信息支持、场外应急力量、救援装备、器材、物品等调度；
4. 医疗救治核心：对伤员进行现场分类、急救处理、进行医学监护，并及时转送医院救治。
5. 消防与抢险核心。由应急救援队伍、公安消防队、专业抢险队、有关工程建筑公司组织的工程抢险队、军队防化兵和工程兵等组成。尽快地控制并消除事故，营救人员。
6. 监测信息核心：迅速测定事故的危害区域范围及危害性质，对空气、水、食物、设备（施）的污染情况，以及气象监测等。
7. 警戒治安核心：组织疏散公众，必须撤离的居民有秩序地撤至安全区或安置区，阻止事故危害区外的公众进入。
8．媒体核心：负责事故和救援信息的统一发布，向公众发布有关保护措施的紧急公告等。

各核心要在事故实际处理中不断协调，形成有机的整体，发挥作用以快速、高效实行现场应急救援行动。